El Estudi General Lul·lià tiene un importante fondo bibliográfico de temática heterogénea, relacionado principalmente con la historia y la cultura de las Islas Baleares, y con ejemplares procedentes de distintas bibliotecas particulares, como la de Gerard Maria Thomàs, Josep Font i Trias o Baltasar Coll Tomàs.

Cuenta también con un fondo documental relacionado con la historia del Estudi General Lul·lià y con las diferentes instituciones y actividades que se han desarrollado en el centro.

Actualmente los fondos bibliográficos y documentales están en fase de ordenación.